Do ponto de vista da biologia, conjugação significa troca ou transferência de material genético entre duas células,organismos ou bactérias normalmente com o objetivo da reprodução, continuando os dois organismos a existir separadamente, como acontece nas bactérias e nos fungos.

Este processo é diferente da singamia, em que as células, por exemplo um espermatozoide penetra num óvulo e juntam, quer o citoplasma (plasmogamia), quer o material genético (cariogamia).

Ocorre nas bactérias através da troca de plasmídeos. Nos protistas ciliados a troca normalmente é do micronúcleo.

Não confundir a conjugação com a fagocitose, em que uma célula engloba outra, para se alimentar.